Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pprc1Q6NZN1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms