Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac4Q6NZM9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hdac4Q6NZM9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hdac4Q6NZM9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hdac4Q6NZM9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hdac4Q6NZM9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hdac4Q6NZM9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac4Q6NZM9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms