Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec23ipQ6NZC7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23ipQ6NZC7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms