Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rprd2Q6NXI6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rprd2Q6NXI6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms