Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HelbQ6NVF4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms