Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2surpQ6NV83 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms