Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Smarca2Q6DIC0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Smarca2Q6DIC0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms