Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2cQ69ZS6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2cQ69ZS6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2cQ69ZS6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2cQ69ZS6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2cQ69ZS6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2cQ69ZS6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2cQ69ZS6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2cQ69ZS6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2cQ69ZS6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2cQ69ZS6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2cQ69ZS6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2cQ69ZS6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2cQ69ZS6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sv2cQ69ZS6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sv2cQ69ZS6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sv2cQ69ZS6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2cQ69ZS6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sv2cQ69ZS6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sv2cQ69ZS6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2cQ69ZS6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2cQ69ZS6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2cQ69ZS6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2cQ69ZS6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2cQ69ZS6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2cQ69ZS6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms