Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jmjd1cQ69ZK6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms