Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cdk13Q69ZA1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms