Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fnip1Q68FD7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fnip1Q68FD7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms