Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q66JV7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q66JV7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q66JV7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q66JV7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q66JV7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q66JV7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q66JV7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q66JV7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q66JV7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q66JV7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q66JV7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q66JV7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q66JV7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q66JV7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q66JV7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q66JV7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q66JV7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q66JV7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q66JV7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q66JV7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q66JV7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q66JV7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q66JV7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q66JV7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q66JV7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q66JV7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q66JV7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q66JV7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q66JV7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q66JV7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q66JV7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q66JV7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q66JV7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q66JV7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q66JV7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q66JV7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q66JV7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q66JV7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q66JV7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q66JV7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q66JV7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q66JV7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q66JV7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q66JV7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q66JV7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q66JV7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q66JV7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q66JV7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q66JV7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q66JV7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q66JV7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q66JV7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q66JV7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q66JV7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q66JV7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q66JV7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q66JV7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q66JV7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q66JV7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q66JV7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q66JV7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q66JV7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q66JV7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q66JV7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q66JV7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q66JV7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q66JV7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q66JV7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q66JV7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q66JV7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q66JV7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Q66JV7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q66JV7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q66JV7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q66JV7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q66JV7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q66JV7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q66JV7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q66JV7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q66JV7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q66JV7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q66JV7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms