Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VclQ64727 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VclQ64727 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VclQ64727 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VclQ64727 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VclQ64727 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VclQ64727 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VclQ64727 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VclQ64727 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VclQ64727 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VclQ64727 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VclQ64727 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VclQ64727 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VclQ64727 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VclQ64727 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VclQ64727 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VclQ64727 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VclQ64727 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VclQ64727 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VclQ64727 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VclQ64727 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VclQ64727 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VclQ64727 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VclQ64727 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VclQ64727 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VclQ64727 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VclQ64727 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VclQ64727 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VclQ64727 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VclQ64727 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VclQ64727 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VclQ64727 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VclQ64727 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VclQ64727 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VclQ64727 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VclQ64727 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VclQ64727 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VclQ64727 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VclQ64727 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VclQ64727 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VclQ64727 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VclQ64727 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VclQ64727 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VclQ64727 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VclQ64727 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VclQ64727 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VclQ64727 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VclQ64727 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VclQ64727 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VclQ64727 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VclQ64727 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VclQ64727 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VclQ64727 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VclQ64727 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VclQ64727 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VclQ64727 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VclQ64727 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VclQ64727 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VclQ64727 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VclQ64727 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VclQ64727 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VclQ64727 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VclQ64727 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VclQ64727 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VclQ64727 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VclQ64727 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VclQ64727 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VclQ64727 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VclQ64727 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VclQ64727 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VclQ64727 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VclQ64727 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VclQ64727 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VclQ64727 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VclQ64727 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VclQ64727 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VclQ64727 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VclQ64727 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VclQ64727 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VclQ64727 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VclQ64727 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VclQ64727 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VclQ64727 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VclQ64727 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VclQ64727 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VclQ64727 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VclQ64727 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VclQ64727 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VclQ64727 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VclQ64727 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VclQ64727 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VclQ64727 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VclQ64727 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VclQ64727 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VclQ64727 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VclQ64727 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VclQ64727 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VclQ64727 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VclQ64727 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VclQ64727 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms