Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms