Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms