Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Col4a5Q63ZW6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms