Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zic2Q62520 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic2Q62520 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms