Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm20854Q62461 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gm20854Q62461 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gm20854Q62461 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gm20854Q62461 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm20854Q62461 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm20854Q62461 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm20854Q62461 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm20854Q62461 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm20854Q62461 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm20854Q62461 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm20854Q62461 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm20854Q62461 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20854Q62461 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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