Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms