Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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