Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3gl2Q62420 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3gl2Q62420 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms