Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Tff3Q62395 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tff3Q62395 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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