Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spock1Q62288 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms