Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SypQ62277 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SypQ62277 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SypQ62277 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SypQ62277 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SypQ62277 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SypQ62277 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SypQ62277 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SypQ62277 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SypQ62277 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SypQ62277 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SypQ62277 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SypQ62277 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SypQ62277 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SypQ62277 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SypQ62277 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SypQ62277 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SypQ62277 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SypQ62277 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SypQ62277 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SypQ62277 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SypQ62277 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SypQ62277 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SypQ62277 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SypQ62277 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SypQ62277 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SypQ62277 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SypQ62277 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SypQ62277 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SypQ62277 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SypQ62277 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SypQ62277 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SypQ62277 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SypQ62277 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SypQ62277 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SypQ62277 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SypQ62277 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SypQ62277 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SypQ62277 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SypQ62277 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SypQ62277 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SypQ62277 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SypQ62277 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SypQ62277 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SypQ62277 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SypQ62277 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SypQ62277 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SypQ62277 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SypQ62277 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SypQ62277 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SypQ62277 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SypQ62277 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SypQ62277 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SypQ62277 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SypQ62277 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SypQ62277 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SypQ62277 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SypQ62277 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SypQ62277 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SypQ62277 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SypQ62277 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SypQ62277 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SypQ62277 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SypQ62277 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SypQ62277 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SypQ62277 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SypQ62277 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SypQ62277 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SypQ62277 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SypQ62277 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SypQ62277 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SypQ62277 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SypQ62277 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SypQ62277 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SypQ62277 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SypQ62277 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SypQ62277 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SypQ62277 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SypQ62277 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SypQ62277 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SypQ62277 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SypQ62277 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SypQ62277 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SypQ62277 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms