Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sall3Q62255 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sall3Q62255 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sall3Q62255 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Sall3Q62255 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Sall3Q62255 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sall3Q62255 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Sall3Q62255 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sall3Q62255 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sall3Q62255 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sall3Q62255 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sall3Q62255 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sall3Q62255 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sall3Q62255 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sall3Q62255 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sall3Q62255 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sall3Q62255 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sall3Q62255 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sall3Q62255 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sall3Q62255 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms