Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a2Q62203 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms