Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SnrpaQ62189 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SnrpaQ62189 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms