Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Ttf1Q62187 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Ttf1Q62187 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Ttf1Q62187 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Ttf1Q62187 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Ttf1Q62187 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
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Ttf1Q62187 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Ttf1Q62187 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Ttf1Q62187 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Ttf1Q62187 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Ttf1Q62187 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Ttf1Q62187 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Ttf1Q62187 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Ttf1Q62187 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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