Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema3cQ62181 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms