Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms