Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctr9Q62018 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms