Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrc1Q61830 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mrc1Q61830 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrc1Q61830 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms