Protein–RNA interactions for Protein: Q61575

Foxn1, Forkhead box protein N1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn1Q61575 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Foxn1Q61575 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxn1Q61575 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms