Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlcamQ61490 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
AlcamQ61490 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AlcamQ61490 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AlcamQ61490 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AlcamQ61490 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlcamQ61490 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlcamQ61490 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AlcamQ61490 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AlcamQ61490 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlcamQ61490 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlcamQ61490 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AlcamQ61490 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AlcamQ61490 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AlcamQ61490 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AlcamQ61490 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AlcamQ61490 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AlcamQ61490 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AlcamQ61490 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AlcamQ61490 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AlcamQ61490 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AlcamQ61490 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AlcamQ61490 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AlcamQ61490 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlcamQ61490 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AlcamQ61490 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlcamQ61490 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlcamQ61490 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlcamQ61490 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlcamQ61490 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
AlcamQ61490 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
AlcamQ61490 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlcamQ61490 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlcamQ61490 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlcamQ61490 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
AlcamQ61490 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlcamQ61490 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlcamQ61490 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlcamQ61490 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlcamQ61490 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms