Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcf12Q61286 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcf12Q61286 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcf12Q61286 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcf12Q61286 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcf12Q61286 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcf12Q61286 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcf12Q61286 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcf12Q61286 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcf12Q61286 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcf12Q61286 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcf12Q61286 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf12Q61286 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf12Q61286 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf12Q61286 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcf12Q61286 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms