Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcfc1Q61191 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcfc1Q61191 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms