Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Trpc6Q61143 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc6Q61143 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms