Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp7Q60973 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp7Q60973 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp7Q60973 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp7Q60973 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp7Q60973 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp7Q60973 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp7Q60973 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp7Q60973 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp7Q60973 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp7Q60973 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp7Q60973 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp7Q60973 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp7Q60973 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp7Q60973 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp7Q60973 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp7Q60973 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms