Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Meis1Q60954 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms