Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik1Q60934 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik1Q60934 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms