Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms