Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdkn2cQ60772 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms