Protein–RNA interactions for Protein: Q60766

Irgm1, Immunity-related GTPase family M protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm1Q60766 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irgm1Q60766 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irgm1Q60766 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms