Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.6 ms