Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sik1Q60670 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sik1Q60670 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms