Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CttnQ60598 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CttnQ60598 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CttnQ60598 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CttnQ60598 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CttnQ60598 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CttnQ60598 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms