Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf123Q5XPI3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rnf123Q5XPI3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms