Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms