Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms