Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp13a3Q5XF89 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms