Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Thoc6Q5U4D9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thoc6Q5U4D9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thoc6Q5U4D9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thoc6Q5U4D9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thoc6Q5U4D9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thoc6Q5U4D9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thoc6Q5U4D9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thoc6Q5U4D9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thoc6Q5U4D9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thoc6Q5U4D9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thoc6Q5U4D9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thoc6Q5U4D9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thoc6Q5U4D9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thoc6Q5U4D9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Thoc6Q5U4D9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Thoc6Q5U4D9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thoc6Q5U4D9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thoc6Q5U4D9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thoc6Q5U4D9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms